More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0790 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  91.01 
 
 
267 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  86.19 
 
 
268 aa  474  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  83.52 
 
 
267 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  43.48 
 
 
274 aa  209  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  45.9 
 
 
592 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  40.68 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.04 
 
 
275 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.77 
 
 
272 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  47.32 
 
 
273 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.7 
 
 
271 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  43.75 
 
 
275 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  45.68 
 
 
274 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  43.98 
 
 
275 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44.86 
 
 
274 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  42.98 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.92 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.83 
 
 
279 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  45.54 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  46.43 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  44.58 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  43.33 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.64 
 
 
277 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  43.33 
 
 
276 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 
276 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  41.47 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 
276 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.35 
 
 
272 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  41.63 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  44.8 
 
 
271 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  42.92 
 
 
276 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  44.49 
 
 
273 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  41.9 
 
 
269 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.09 
 
 
273 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  40.94 
 
 
274 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.94 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  41.77 
 
 
309 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  42.51 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  43.75 
 
 
279 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.57 
 
 
275 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.02 
 
 
281 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  42.52 
 
 
275 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  38.15 
 
 
284 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.18 
 
 
303 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  44.77 
 
 
279 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  42.31 
 
 
277 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
278 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  39.53 
 
 
281 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  37.5 
 
 
268 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  37.4 
 
 
286 aa  165  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  40.32 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.74 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  42.53 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  41.99 
 
 
689 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  37.78 
 
 
278 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  40.57 
 
 
283 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.78 
 
 
301 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  40.44 
 
 
281 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.81 
 
 
273 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  38.56 
 
 
285 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  39.51 
 
 
276 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  36.95 
 
 
303 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.52 
 
 
297 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.6 
 
 
280 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40.72 
 
 
291 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  38.78 
 
 
293 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.34 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.06 
 
 
297 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  46.84 
 
 
622 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.65 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38 
 
 
270 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.27 
 
 
555 aa  149  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.14 
 
 
276 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  39.37 
 
 
269 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  37.74 
 
 
279 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.14 
 
 
276 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.29 
 
 
289 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.14 
 
 
276 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40.09 
 
 
277 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.19 
 
 
263 aa  148  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40.09 
 
 
267 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  35.56 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  37.21 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.93 
 
 
297 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  39.64 
 
 
629 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  36.89 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.36 
 
 
624 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.72 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  36.14 
 
 
273 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1962  transketolase, N-terminal subunit  40.33 
 
 
274 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.52 
 
 
267 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  36.11 
 
 
288 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.55 
 
 
288 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  38.8 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  38.8 
 
 
311 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  38.8 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  38.8 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  38.8 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  38.8 
 
 
272 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>