246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2850 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  77.34 
 
 		 578 aa  961    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1202    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  51.38 
 
 		 588 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  32.25 
 
 		 585 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  32.25 
 
 		 585 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 627 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  28.53 
 
 		 625 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  26.67 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  27.91 
 
 		 628 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  28.13 
 
 		 629 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  27.36 
 
 		 643 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  26.71 
 
 		 639 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.57 
 
 		 637 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.5 
 
 		 634 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  25.42 
 
 		 634 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  27.11 
 
 		 650 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  26.6 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  23.31 
 
 		 622 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  30.8 
 
 		 631 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  59.09 
 
 		 109 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  24.39 
 
 		 707 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  29.39 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.96 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 845 aa  63.9  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  23.71 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 706 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 1032 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.47 
 
 		 781 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.81 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 679 aa  57  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 742 aa  57  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  22.69 
 
 		 666 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.09 
 
 		 735 aa  56.2  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 716 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 697 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 646 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 733 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.9 
 
 		 694 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 709 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 726 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 795 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.37 
 
 		 668 aa  53.9  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.26 
 
 		 677 aa  53.9  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 677 aa  53.9  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 725 aa  53.9  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 831 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 932 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.93 
 
 		 785 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.46 
 
 		 757 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.43 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.86 
 
 		 715 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 671 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.46 
 
 		 765 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.32 
 
 		 671 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 794 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  22.88 
 
 		 706 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.56 
 
 		 748 aa  52  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.45 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.09 
 
 		 670 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.23 
 
 		 762 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 670 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  32.58 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 807 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.77 
 
 		 797 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 758 aa  51.2  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 		 817 aa  50.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  23.88 
 
 		 726 aa  50.8  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  27.03 
 
 		 1183 aa  51.2  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 		 806 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.18 
 
 		 671 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.82 
 
 		 671 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  25.67 
 
 		 552 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.43 
 
 		 837 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.09 
 
 		 754 aa  50.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 731 aa  50.4  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  22.56 
 
 		 771 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  25.57 
 
 		 1050 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.29 
 
 		 719 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 768 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.44 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 751 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 751 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.99 
 
 		 711 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  22.59 
 
 		 797 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  28.98 
 
 		 657 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>