168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2157 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
138 aa  271  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  37.96 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  35.25 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  55.74 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  33.54 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  31.61 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  31.06 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  34.23 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  42.86 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  30.71 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  50.85 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  35.56 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  43.84 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  41.98 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  43.66 
 
 
515 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  39.76 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 
66 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  32.61 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  32.69 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  48.33 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  48.33 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  48.33 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  48.33 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  22.99 
 
 
244 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  34.31 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  50.82 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  33.58 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  48.33 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  48.28 
 
 
240 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  38.67 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  45 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  32.37 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  35.06 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 
416 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
58 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  45 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
578 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  45 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
194 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  27.72 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  37.33 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  33.64 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 
306 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  41.67 
 
 
61 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  41.67 
 
 
61 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
418 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  27 
 
 
847 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.42 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.33 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.46 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 
248 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  43.1 
 
 
419 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.08 
 
 
119 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  45.61 
 
 
70 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
143 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
547 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  38.46 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  38.46 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  38.46 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.72 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.72 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.72 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.72 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.72 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  43.59 
 
 
233 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
394 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 
466 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
481 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  36.14 
 
 
346 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  58.33 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.94 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  31.96 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 
552 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  31.96 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>