198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4570 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 
464 aa  964    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  62.01 
 
 
433 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  61.66 
 
 
438 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  61.66 
 
 
438 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  48.39 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  49.44 
 
 
437 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  48.86 
 
 
437 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  46.17 
 
 
444 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  46.65 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  44.15 
 
 
456 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  43.53 
 
 
455 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  43.11 
 
 
459 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  45.39 
 
 
424 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  44.8 
 
 
458 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  42.86 
 
 
460 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  45.53 
 
 
379 aa  330  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  35.82 
 
 
399 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  34.93 
 
 
398 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
393 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  33.43 
 
 
425 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  35.6 
 
 
445 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  31.53 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  33.43 
 
 
423 aa  173  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  30.62 
 
 
411 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.73 
 
 
407 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  29.51 
 
 
431 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  29.51 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  29.41 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  28.92 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  31.44 
 
 
432 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 
409 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  27.88 
 
 
410 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  30.42 
 
 
411 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.73 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  28.41 
 
 
405 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.3 
 
 
409 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 
412 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  30.2 
 
 
423 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
432 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  28.47 
 
 
440 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  26.6 
 
 
411 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.61 
 
 
432 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  26.07 
 
 
406 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  27.9 
 
 
432 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  29.22 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  25.63 
 
 
417 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  28.61 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.46 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  29.64 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  27.48 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  27.9 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  28.39 
 
 
432 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.61 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  26.67 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  28.5 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.53 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  26.67 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  26.67 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.28 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.66 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  26.67 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  26.87 
 
 
426 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.61 
 
 
425 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  29.46 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  27.34 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.63 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.65 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  26.42 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.25 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  28.29 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.66 
 
 
429 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  26.12 
 
 
427 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  26.95 
 
 
431 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  28.96 
 
 
422 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  27.5 
 
 
430 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  26.12 
 
 
427 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.12 
 
 
427 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  26.12 
 
 
427 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.65 
 
 
412 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  26.12 
 
 
427 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  26.12 
 
 
427 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  26.12 
 
 
427 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  25.53 
 
 
422 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.98 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  25.87 
 
 
427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.55 
 
 
411 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  25.59 
 
 
433 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  25.93 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  25.86 
 
 
418 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  27.92 
 
 
409 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  25.49 
 
 
418 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  26.3 
 
 
436 aa  120  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  26.3 
 
 
436 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  26.3 
 
 
432 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>