More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1585 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  100 
 
 
157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  78.85 
 
 
153 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  84.14 
 
 
167 aa  251  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  82.64 
 
 
154 aa  251  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  80.14 
 
 
153 aa  239  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  76.71 
 
 
154 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  75.34 
 
 
154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  75.34 
 
 
154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  75.34 
 
 
154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  72.19 
 
 
154 aa  231  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  71.79 
 
 
170 aa  231  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  72.19 
 
 
154 aa  231  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  73.97 
 
 
154 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  72.67 
 
 
161 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  73.97 
 
 
154 aa  228  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  70.67 
 
 
151 aa  227  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  74.66 
 
 
170 aa  226  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  68.79 
 
 
161 aa  225  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  72.6 
 
 
183 aa  223  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  71.33 
 
 
167 aa  223  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  70.47 
 
 
165 aa  221  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  68.24 
 
 
156 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  70.55 
 
 
163 aa  219  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  71.23 
 
 
151 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  71.72 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  66.67 
 
 
153 aa  218  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  71.03 
 
 
178 aa  217  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  71.43 
 
 
163 aa  216  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  67.59 
 
 
170 aa  214  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  66.45 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  68.49 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
160 aa  210  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  67.57 
 
 
181 aa  204  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  67.12 
 
 
163 aa  204  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
186 aa  203  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  59.6 
 
 
151 aa  193  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 
166 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
150 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
149 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
163 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
174 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
173 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 
165 aa  141  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
150 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  50.97 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  50.97 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  50.97 
 
 
154 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  43.31 
 
 
158 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  50.33 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  49.01 
 
 
154 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 
154 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
149 aa  137  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  49.68 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  49.01 
 
 
155 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  49.68 
 
 
175 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
149 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
153 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  47.13 
 
 
152 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  48.08 
 
 
174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  43.87 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>