More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1091 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  54.15 
 
 		 302 aa  325  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  57.62 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  56.03 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  53.43 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  58.69 
 
 		 294 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  54.77 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  52.35 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  54.23 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  53.93 
 
 		 287 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  52.26 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  47.08 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  48.42 
 
 		 289 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  49.09 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  48.07 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  50 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  50 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  50 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  50 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  51.8 
 
 		 293 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  50 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  48.94 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  48.94 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  49.29 
 
 		 289 aa  279  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  52.14 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  48.94 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  49.3 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  49.3 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  48.94 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  49.63 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  52.5 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  46.55 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  52.14 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  51.29 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  48.23 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  47.55 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  48.41 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  48.77 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  48.77 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  47.15 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  49.12 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  49.81 
 
 		 292 aa  271  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  47.69 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  52.33 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  48.94 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  51.94 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  44.48 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  46.72 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  42.71 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  47.65 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  43.84 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  47.37 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  44.64 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  41.88 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  40.94 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  42.52 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  42.81 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  44.8 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  45.09 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  44.17 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  46.57 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  38.68 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  44.17 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  43.21 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  45.23 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  44.6 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  44.57 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  45.19 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  37.96 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  37.96 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  38.84 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  37.96 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  46.62 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.24 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  38.12 
 
 		 331 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  45.11 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  37.81 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  39.34 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  39.34 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.09 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.43 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  39.94 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  40.86 
 
 		 290 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  44.13 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  37.69 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  39.61 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  39.61 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  39.61 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  39.61 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  39.61 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  38.51 
 
 		 334 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>