More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2385 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  84.18 
 
 		 297 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  73.06 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  72.73 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  70.71 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  49.66 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  45.55 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  48.14 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  46.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  41.5 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  43.93 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  39.6 
 
 		 316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  45.24 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.45 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  35.69 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  40.68 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  32.44 
 
 		 328 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  36.36 
 
 		 331 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  34.34 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  34.62 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  32.67 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  31.02 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.43 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 338 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  30.69 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  30.88 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  31.05 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.56 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.98 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.92 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  27.1 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  30.88 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  31.35 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.77 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.81 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.73 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.49 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  28.73 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.87 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.16 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.34 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.88 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.24 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.7 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.71 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.15 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  30.82 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.47 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  29.89 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  30.38 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  32.71 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.49 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  29.67 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.87 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.3 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.22 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.68 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  30.64 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.05 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.27 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.37 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  26.88 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>