More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1780 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1780  integrase family protein  100 
 
 		 364 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4446  Site-specific recombinase XerD-like protein  67.1 
 
 		 375 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000279305  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  67.13 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  44.14 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  37.71 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  33.15 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.66 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  32.88 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.43 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.13 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  32.33 
 
 		 295 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  30.96 
 
 		 297 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.82 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.82 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.82 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.7 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 296 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 296 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 322 aa  96.7  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  32.71 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.17 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.34 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  30.93 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.03 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.89 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.04 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.53 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 291 aa  93.2  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  30.59 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  33.49 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.42 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  30.24 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  33.17 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.19 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  34.29 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  34.13 
 
 		 297 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.03 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  31.31 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  39.34 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 299 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 299 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  34.03 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.83 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  39.29 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  38.04 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  35.86 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  27.17 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  35.37 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.65 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  31.1 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.12 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.16 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  36.73 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.65 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  31.96 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.65 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  37.17 
 
 		 472 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  29.39 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  38 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  40.13 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.33 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  35.26 
 
 		 310 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.82 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  37.2 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  34.67 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.19 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28.96 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.87 
 
 		 302 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 304 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 330 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.46 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  34.16 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.15 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>