More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1539 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.1 
 
 
1561 aa  1623    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.26 
 
 
1602 aa  992    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1542 aa  3130    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.93 
 
 
1525 aa  1231    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.52 
 
 
1543 aa  1345    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
1589 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  30.85 
 
 
1578 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.61 
 
 
1607 aa  1009    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.52 
 
 
1543 aa  1345    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  27.75 
 
 
2093 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  27.14 
 
 
1784 aa  394  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.44 
 
 
2099 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.39 
 
 
1734 aa  254  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1741 aa  244  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.6 
 
 
1770 aa  227  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.65 
 
 
1787 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  29.12 
 
 
1838 aa  186  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.02 
 
 
1698 aa  186  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.51 
 
 
1764 aa  185  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
1711 aa  174  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  27.58 
 
 
2104 aa  171  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.31 
 
 
2104 aa  170  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  26.2 
 
 
1422 aa  169  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 
2104 aa  169  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.99 
 
 
2113 aa  169  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  27.41 
 
 
2097 aa  169  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1743 aa  166  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.75 
 
 
2136 aa  165  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
2113 aa  164  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.2 
 
 
2113 aa  164  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  32.2 
 
 
2113 aa  164  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.96 
 
 
1695 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  27.9 
 
 
2106 aa  162  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.76 
 
 
1741 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.55 
 
 
1723 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
1722 aa  157  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.31 
 
 
1672 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.5 
 
 
1711 aa  156  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.49 
 
 
1759 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.08 
 
 
2104 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.15 
 
 
685 aa  154  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.41 
 
 
1740 aa  153  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.61 
 
 
1861 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.41 
 
 
1723 aa  150  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 
1754 aa  145  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  32.45 
 
 
2224 aa  145  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.23 
 
 
2120 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 
1719 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.52 
 
 
1765 aa  143  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  35.46 
 
 
2082 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  35.25 
 
 
2125 aa  140  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 
1725 aa  138  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  27.12 
 
 
1704 aa  136  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  34.4 
 
 
2124 aa  135  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  25.52 
 
 
2087 aa  135  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 
2213 aa  135  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  25.12 
 
 
1878 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.43 
 
 
1780 aa  128  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  32.3 
 
 
321 aa  109  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  30.05 
 
 
459 aa  109  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.21 
 
 
1948 aa  101  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 
744 aa  96.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
815 aa  96.3  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
744 aa  96.3  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.73 
 
 
744 aa  94  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  36.23 
 
 
797 aa  92.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.18 
 
 
739 aa  92.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.02 
 
 
962 aa  92.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.33 
 
 
744 aa  92.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
751 aa  89  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  29.81 
 
 
758 aa  87.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.86 
 
 
1198 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.85 
 
 
815 aa  83.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
740 aa  82.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
973 aa  82  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  29.15 
 
 
905 aa  81.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.99 
 
 
941 aa  80.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 
685 aa  79.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  31.48 
 
 
986 aa  79  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  30.99 
 
 
912 aa  78.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.1 
 
 
763 aa  78.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.58 
 
 
768 aa  78.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1053 aa  78.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.6 
 
 
959 aa  78.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.16 
 
 
759 aa  77.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
764 aa  77  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  30.15 
 
 
764 aa  75.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.73 
 
 
764 aa  75.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
762 aa  75.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.21 
 
 
807 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.95 
 
 
972 aa  74.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.14 
 
 
758 aa  73.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  27.57 
 
 
1210 aa  73.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 
937 aa  73.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  28.38 
 
 
815 aa  73.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 
928 aa  72.4  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
868 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.56 
 
 
879 aa  71.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
1086 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.28 
 
 
753 aa  70.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>