More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1459 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  69.66 
 
 
492 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  73.33 
 
 
485 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  76.92 
 
 
487 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.16 
 
 
495 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  68.23 
 
 
480 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.65 
 
 
484 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  78.14 
 
 
492 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  70.28 
 
 
489 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  68.29 
 
 
481 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  100 
 
 
494 aa  994    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.86 
 
 
488 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  70.28 
 
 
489 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  68.67 
 
 
488 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.4 
 
 
484 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  66.27 
 
 
491 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  66.73 
 
 
488 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  67.87 
 
 
486 aa  626  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  65.19 
 
 
486 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  64.93 
 
 
493 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.65 
 
 
485 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  62.35 
 
 
485 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.28 
 
 
471 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  61.94 
 
 
485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.27 
 
 
491 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.76 
 
 
488 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.41 
 
 
489 aa  548  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.61 
 
 
488 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.72 
 
 
488 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.9 
 
 
501 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.12 
 
 
494 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  51.9 
 
 
500 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  52.85 
 
 
502 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.77 
 
 
495 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.83 
 
 
487 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.35 
 
 
487 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.59 
 
 
496 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.38 
 
 
495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  54.41 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.18 
 
 
495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.47 
 
 
500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.75 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.56 
 
 
502 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.18 
 
 
495 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.25 
 
 
486 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.06 
 
 
501 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.56 
 
 
502 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.78 
 
 
502 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.56 
 
 
502 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.47 
 
 
492 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  54.69 
 
 
479 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.79 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.33 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  56.78 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  51.9 
 
 
491 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.33 
 
 
489 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  58.8 
 
 
488 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 
506 aa  498  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.99 
 
 
501 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.02 
 
 
488 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.41 
 
 
489 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  52.13 
 
 
489 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  52.5 
 
 
512 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.72 
 
 
490 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  51.82 
 
 
488 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  52.47 
 
 
472 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  52.22 
 
 
488 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  52.22 
 
 
488 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  50.7 
 
 
489 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.94 
 
 
484 aa  491  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  51.12 
 
 
489 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  53.02 
 
 
487 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  52.42 
 
 
487 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.86 
 
 
478 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  52.69 
 
 
491 aa  491  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  50.4 
 
 
488 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  52.02 
 
 
487 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 
489 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.58 
 
 
495 aa  485  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.67 
 
 
501 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.79 
 
 
494 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  51.2 
 
 
492 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  51.32 
 
 
480 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 
492 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  51.41 
 
 
488 aa  485  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 
488 aa  485  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  50.6 
 
 
491 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  51.3 
 
 
491 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  49.8 
 
 
488 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 
491 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.65 
 
 
461 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 
489 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  51.2 
 
 
484 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 
488 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  50.6 
 
 
484 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  50.5 
 
 
491 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.47 
 
 
482 aa  478  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 
496 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  52.22 
 
 
488 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  50.3 
 
 
490 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  51.41 
 
 
505 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>