More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2551 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  66.67 
 
 		 121 aa  176  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 121 aa  173  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  63.33 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  60.33 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  60 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  58.82 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 122 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 122 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  63.56 
 
 		 120 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  57.02 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  57.63 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  58.93 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  56.78 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  56.78 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  55.93 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  55.37 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  55.17 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  55.08 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  51.69 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  50.89 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  45.76 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  52.54 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  53.57 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  46.3 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 204 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 225 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 225 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.74 
 
 		 488 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 313 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  39.32 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  40 
 
 		 230 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 225 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 318 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  44.25 
 
 		 351 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.98 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 367 aa  95.9  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.74 
 
 		 427 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  95.9  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 301 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>