More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1031 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  53.93 
 
 		 192 aa  217  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  54.76 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  52.43 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  43.78 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  47.45 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  45.45 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  47.13 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  46.89 
 
 		 211 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  47.13 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  46.82 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  46.82 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  47.09 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  45.51 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  47.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  46.89 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  47.02 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  45.2 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  45.2 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  45.2 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  41.71 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  41.21 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  41.21 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  44.63 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  44.63 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  43.1 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  41.58 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  43.45 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  39.77 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  42.11 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  40.43 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.47 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  41.67 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  35.98 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  40.7 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  40.12 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  36.65 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  36.14 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.78 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  33.54 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  40.94 
 
 		 254 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.11 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.91 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.87 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  40 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  40.7 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  37.77 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  36.51 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  35.98 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  47.46 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  35.98 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  35.11 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.5 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  35.87 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.04 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  34.5 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  37.09 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  34.24 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  34.24 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.27 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  30.27 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  31.11 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  31.38 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.87 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  31.22 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.5 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  33.72 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  30.46 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.26 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.64 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  30.86 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.09 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.82 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.14 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.46 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  29.63 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.14 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.78 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  31.48 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  35.39 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30.46 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.39 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  35.39 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  34.2 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  33.33 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.24 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.73 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  31.77 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.2 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  33.51 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  33.33 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  30.85 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  34.23 
 
 		 285 aa  91.7  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.59 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  34.9 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  32.47 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>