More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0813 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0813  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0790  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0179  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00103774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0412  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.18 
 
 
211 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 
233 aa  94.4  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
210 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  34.24 
 
 
199 aa  84.3  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  31.64 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  33.71 
 
 
200 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  33.33 
 
 
200 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.65 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  32.23 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.15 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  31.35 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  33.88 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.85 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  31.69 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.34 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.65 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.18 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  33.85 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  30.52 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  27.96 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.01 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.65 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.34 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  28.37 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>