219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1583 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
338 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  38.7 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  41.05 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  40.13 
 
 
344 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  37.91 
 
 
342 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  37.55 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  33.79 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  32.8 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  31.69 
 
 
330 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.68 
 
 
329 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  33.68 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.15 
 
 
330 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  31.94 
 
 
336 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  33.33 
 
 
326 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  33.33 
 
 
326 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.01 
 
 
332 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.72 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  30.19 
 
 
336 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  31.9 
 
 
326 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  31.7 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.3 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.64 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  31.02 
 
 
323 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  32.73 
 
 
385 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  29.31 
 
 
359 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.1 
 
 
328 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  29.08 
 
 
323 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  32.14 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.69 
 
 
674 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  30.54 
 
 
375 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  32.35 
 
 
343 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
915 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  31.27 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  29.85 
 
 
350 aa  94  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  29.75 
 
 
778 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  32.46 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  28.94 
 
 
330 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.55 
 
 
1075 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  27.19 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.75 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  30.82 
 
 
686 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.82 
 
 
1238 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.39 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.66 
 
 
856 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  30.87 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.73 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27.84 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.55 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  27.24 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.36 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  28.87 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  27.91 
 
 
775 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.41 
 
 
1065 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  29.29 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.44 
 
 
821 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  25.08 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.39 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.39 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  26.24 
 
 
794 aa  75.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1004 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  25.5 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.94 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.81 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  27.08 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.4 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.19 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 
1004 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.9 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.9 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.83 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.94 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.24 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  29.3 
 
 
721 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.17 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  23.19 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  28.4 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.11 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.97 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  23.48 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  25.55 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.21 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.37 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.7 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.64 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  26.8 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.34 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.37 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25 
 
 
593 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>