117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2294 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  33.83 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  24.9 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  24.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  22.65 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  23.98 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  21.76 
 
 
216 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0262  HAD family phosphatase  35.96 
 
 
166 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161792  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
223 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.04 
 
 
228 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  28.39 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  25.97 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  23.5 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  27.03 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.86 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  24.9 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.36 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  23.44 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  23.73 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  23.73 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  24.48 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  22.5 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  22.5 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.63 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.9 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.24 
 
 
250 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25.7 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.33 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.62 
 
 
237 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.77 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  22 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  22 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  22 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  22 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  25 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.95 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  27.45 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.93 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.31 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.07 
 
 
234 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.55 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  23.9 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  23.04 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  30.61 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  22.18 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.31 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.51 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  24 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  28.67 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.41 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  22.16 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.28 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  23.92 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  48.84 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.28 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  22.83 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.32 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.37 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  22.82 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.37 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  21.5 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  29 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  26.26 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  27.37 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.39 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.37 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.88 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  21.99 
 
 
246 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.45 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
226 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>