More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12706 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  77.48 
 
 		 223 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  78.6 
 
 		 217 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  78.6 
 
 		 217 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  78.6 
 
 		 217 aa  350  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  75.68 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  62.1 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  62.27 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  60.45 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  59.26 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  59.72 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  59.72 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  60.66 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  60.8 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  56.6 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  57.48 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  54.79 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  51.82 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  56.36 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  50.91 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  50.23 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  52.29 
 
 		 223 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  55.2 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  48.37 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  54.64 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  55.67 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  49.75 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  48.84 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  51.71 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  50.72 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  50.51 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  43.35 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  43.96 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  41.55 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  47.39 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  49.59 
 
 		 137 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  41.98 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  33 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  49.57 
 
 		 134 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  48.72 
 
 		 134 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  48.72 
 
 		 134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  38.46 
 
 		 134 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  41.38 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  37.6 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.28 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  28.38 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.85 
 
 		 626 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 142 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  30.84 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  34.12 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 		 628 aa  82  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  36.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.67 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  37.93 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  27.57 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.6 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  30.81 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  26.92 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  31.13 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  30.09 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  27.7 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  23.9 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  25.51 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  28.71 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  24.65 
 
 		 458 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.81 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  26.46 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28.97 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  31.3 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>