214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11333 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  56.21 
 
 
166 aa  187  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  57.58 
 
 
171 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  54.12 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  54.12 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  54.12 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.33 
 
 
166 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.33 
 
 
170 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  37.41 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.57 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  35.14 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  35.14 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.32 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.5 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.72 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  35.85 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.21 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  30.14 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  27.92 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.53 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  25.76 
 
 
448 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  24.11 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  26.95 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  27.97 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.88 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  32.23 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  24.16 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.61 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  26.87 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  26.24 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  24.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  25.49 
 
 
203 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  25.62 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  26.12 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.11 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  25.2 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.8 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 
443 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 
443 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 
443 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  24.81 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  24.32 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>