More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0641 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.31 
 
 		 645 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.05 
 
 		 644 aa  824    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.71 
 
 		 637 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.25 
 
 		 647 aa  785    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.43 
 
 		 636 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.8 
 
 		 648 aa  811    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.38 
 
 		 637 aa  782    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.04 
 
 		 657 aa  813    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.9 
 
 		 638 aa  747    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.21 
 
 		 646 aa  835    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.87 
 
 		 638 aa  788    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.91 
 
 		 637 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.56 
 
 		 643 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.38 
 
 		 640 aa  781    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.55 
 
 		 646 aa  770    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.88 
 
 		 638 aa  901    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.09 
 
 		 646 aa  775    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.93 
 
 		 639 aa  866    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.84 
 
 		 657 aa  821    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.24 
 
 		 637 aa  761    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.28 
 
 		 662 aa  816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.85 
 
 		 679 aa  806    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 635 aa  1306    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.94 
 
 		 656 aa  817    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.21 
 
 		 636 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.34 
 
 		 638 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.59 
 
 		 652 aa  774    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.72 
 
 		 645 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.25 
 
 		 643 aa  840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  63.35 
 
 		 646 aa  811    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.84 
 
 		 638 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.74 
 
 		 636 aa  779    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.36 
 
 		 642 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.24 
 
 		 654 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.58 
 
 		 636 aa  780    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.42 
 
 		 637 aa  832    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.18 
 
 		 637 aa  763    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  59.65 
 
 		 639 aa  740    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.52 
 
 		 666 aa  782    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.34 
 
 		 637 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.05 
 
 		 649 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  59.97 
 
 		 642 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.09 
 
 		 656 aa  822    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.32 
 
 		 646 aa  760    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  64.78 
 
 		 646 aa  831    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59 
 
 		 638 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.28 
 
 		 658 aa  807    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.95 
 
 		 637 aa  821    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.37 
 
 		 672 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.78 
 
 		 646 aa  800    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  62.42 
 
 		 648 aa  827    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.23 
 
 		 735 aa  797    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.91 
 
 		 659 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.87 
 
 		 638 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.93 
 
 		 638 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.64 
 
 		 637 aa  789    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  57.66 
 
 		 667 aa  799    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.31 
 
 		 638 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.04 
 
 		 664 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.88 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 585 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 588 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 588 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.31 
 
 		 585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 		 597 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.72 
 
 		 597 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.72 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.72 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.72 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.55 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.6 
 
 		 593 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.09 
 
 		 588 aa  332  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.54 
 
 		 585 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.85 
 
 		 625 aa  312  9e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.61 
 
 		 578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  30.07 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.66 
 
 		 575 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.29 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.62 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.14 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.14 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.58 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  28.02 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.05 
 
 		 595 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.41 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.44 
 
 		 662 aa  193  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.7 
 
 		 566 aa  193  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.6 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  29.19 
 
 		 585 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.45 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.86 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.25 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.95 
 
 		 598 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.96 
 
 		 617 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.4 
 
 		 596 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>