More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1537 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  912    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  70.54 
 
 		 449 aa  614  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  65.25 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  58.66 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  56.4 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  55.96 
 
 		 450 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.52 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.52 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.3 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.14 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  37 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  39.04 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  39.5 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  38.88 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  36.85 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  37.19 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 		 463 aa  249  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  38.55 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  38.85 
 
 		 462 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 		 468 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  36.28 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  34.23 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  35.39 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  31.14 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.74 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1024 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1024 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  23.13 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.41 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.83 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  28.54 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  25.22 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  24.69 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.86 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  25.16 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.89 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.71 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  25.45 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  23.81 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.36 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  28.17 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  25.17 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  24.59 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  24.59 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.12 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.94 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  23.82 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  24.66 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  22.47 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  25.45 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.42 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.76 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  24.66 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  25.47 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.33 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  23.35 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.88 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.67 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  23.78 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  25.87 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  30.86 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.12 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  28.05 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  23.8 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  23.72 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.42 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.08 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.8 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  26.91 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  23.84 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  23.8 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.8 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.92 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.88 
 
 		 890 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  23.45 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  23.8 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  24.76 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.73 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  24 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  23.8 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  23.8 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.86 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  27.78 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  34.07 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  22.81 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>