102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1436 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  100 
 
 		 164 aa  346  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  33.09 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  46.77 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  34.51 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  34.51 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  34.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  33.63 
 
 		 292 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 240 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 459 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 477 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 443 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  36.96 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  36.92 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  60.61 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  60.61 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  62.07 
 
 		 81 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 452 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 81 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  28.85 
 
 		 1138 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 427 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  36.21 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 315 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 552 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  41.03 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4857  HNH endonuclease  30.23 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  31.43 
 
 		 1173 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  37.5 
 
 		 354 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  30.59 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  42.59 
 
 		 423 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 253 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.85 
 
 		 1395 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  35 
 
 		 465 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  42 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  31.15 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  31.15 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  29.63 
 
 		 1131 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  29.81 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  31.15 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 465 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  38 
 
 		 438 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  39.51 
 
 		 435 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  32.35 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  33.9 
 
 		 174 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  30.61 
 
 		 184 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  30.61 
 
 		 184 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  40 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.07 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  31.15 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  30.68 
 
 		 427 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  44 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  27.68 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 459 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  44 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  28.17 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 535 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>