105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3360 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  100 
 
 		 423 aa  842    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  67.48 
 
 		 437 aa  524  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  87.56 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  48.03 
 
 		 430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  48.03 
 
 		 430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  44.67 
 
 		 457 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  45.91 
 
 		 474 aa  279  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  47.68 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  45.43 
 
 		 475 aa  276  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  47.42 
 
 		 434 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  47.42 
 
 		 434 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  41.93 
 
 		 547 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  46.72 
 
 		 479 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  46.91 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  46.91 
 
 		 377 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  46.91 
 
 		 377 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  45.85 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  43.94 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  45.12 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  43.36 
 
 		 426 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  42.94 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  41.35 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  41.35 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  40.2 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  38.38 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  37.4 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  40.52 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  40.52 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  40.52 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  38.56 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  38.55 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  42.92 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  38.46 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  33.76 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  32.08 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.01 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  33.64 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  30.02 
 
 		 594 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  29.29 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26 
 
 		 567 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  31.33 
 
 		 510 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.88 
 
 		 568 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.97 
 
 		 556 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  28.29 
 
 		 620 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.56 
 
 		 499 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.47 
 
 		 508 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.34 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.17 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.68 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.18 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.65 
 
 		 585 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  26.21 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  27.49 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  32.77 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.18 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  25.76 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.02 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.78 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  27.11 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.37 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.91 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.79 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  35 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.09 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  27.07 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  30.3 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  27.07 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.82 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.59 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  31.5 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.4 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.59 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.48 
 
 		 637 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.5 
 
 		 584 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  29.8 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.13 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  27.1 
 
 		 523 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  28.47 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  25.71 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  28.06 
 
 		 539 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  33 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  26.25 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  26.25 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  37.04 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  26.46 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  30.99 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  30.71 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  42.59 
 
 		 164 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.04 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4807  hypothetical protein  55.26 
 
 		 75 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.460764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  28.36 
 
 		 550 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  26.8 
 
 		 521 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>