More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1781 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  78.21 
 
 
438 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  100 
 
 
456 aa  935    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  56.28 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  57.32 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  53.27 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  51.54 
 
 
465 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  53.46 
 
 
460 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  50.9 
 
 
492 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
497 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  36.27 
 
 
443 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.26 
 
 
497 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  36.03 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  35.7 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  37.03 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.68 
 
 
450 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.68 
 
 
450 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  35.6 
 
 
442 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  32.8 
 
 
668 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  32.78 
 
 
498 aa  180  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.1 
 
 
468 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  27.8 
 
 
510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.97 
 
 
334 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  26.9 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.22 
 
 
367 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
357 aa  93.2  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.5 
 
 
338 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  26.94 
 
 
358 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.64 
 
 
327 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.79 
 
 
315 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.21 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.82 
 
 
349 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  33.52 
 
 
353 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.82 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.84 
 
 
373 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.72 
 
 
337 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.9 
 
 
331 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.57 
 
 
407 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  30.18 
 
 
342 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.82 
 
 
387 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  30.73 
 
 
347 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  31.02 
 
 
355 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
367 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  30.48 
 
 
348 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.51 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  34.3 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.02 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.62 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  33.52 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  31.74 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  31.25 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.18 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.22 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  34.93 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  31.28 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.64 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  28.8 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  29.86 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.76 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.19 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  27.89 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  25.46 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.28 
 
 
353 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  28.9 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.78 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  38.35 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
372 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  25.67 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  35.94 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  28.48 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.16 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  26.06 
 
 
352 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  27.92 
 
 
354 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  28.79 
 
 
354 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  25.41 
 
 
357 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  25 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.02 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.49 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  27.13 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  32.56 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  29.24 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  24.32 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  28.11 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  26.87 
 
 
369 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.04 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  29.94 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  26.54 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.64 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.48 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.18 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.09 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.7 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>