125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4033 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  60 
 
 		 513 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1046    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  51.75 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  53.26 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  43.71 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  41.78 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  23.93 
 
 		 542 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  22.59 
 
 		 504 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  24.49 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  22.45 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  22.32 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.83 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.13 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  20.38 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.33 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.75 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.15 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  21.85 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.01 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.31 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  23.92 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.12 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  23.09 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.88 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.8 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.53 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.04 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  23.63 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.62 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  19.92 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.78 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  33.06 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.88 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.7 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.7 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.12 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  22.51 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  20.6 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.4 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  34.69 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.1 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 180 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  35.56 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  23.77 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  20.18 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 		 179 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 		 179 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 		 646 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  27.82 
 
 		 179 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  27.82 
 
 		 179 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 		 532 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 		 179 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 		 176 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.44 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  24.17 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  27.42 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  19.77 
 
 		 609 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 158 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  28.68 
 
 		 643 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  21.86 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  26.98 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  28.46 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  25.5 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  34.78 
 
 		 766 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  24.69 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.19 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  20.46 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  36.27 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  26.05 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  36.47 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  36.47 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.43 
 
 		 170 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  36.14 
 
 		 180 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  31.33 
 
 		 539 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  21.05 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  27.91 
 
 		 555 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>