More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1054 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1054  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  100 
 
 
493 aa  999    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.51 
 
 
686 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 
612 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0530  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.96 
 
 
579 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.82222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.4 
 
 
782 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.05 
 
 
653 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.7 
 
 
638 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.97 
 
 
878 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  41.78 
 
 
610 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.92 
 
 
509 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.38 
 
 
556 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.15 
 
 
908 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.16 
 
 
507 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
535 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
627 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.63 
 
 
672 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  51.22 
 
 
672 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0307  sensor histidine kinase (sporulation kinase), C-terminal region  50.81 
 
 
677 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0303  sensor histidine kinase; sporulation kinase  50.81 
 
 
677 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00332628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5581  sensor histidine kinase  50.81 
 
 
672 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5365  sensor histidine kinase  51.88 
 
 
672 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00212715  hitchhiker  0.0000000443209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  51.02 
 
 
676 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.54 
 
 
599 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3094  histidine kinase  50.93 
 
 
246 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.24 
 
 
744 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.87 
 
 
578 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.19 
 
 
833 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
713 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  28.6 
 
 
801 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  28.21 
 
 
801 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
738 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
775 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  27.72 
 
 
801 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  27.72 
 
 
801 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  29.68 
 
 
635 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
801 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
1089 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
891 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
957 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
1080 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  29.92 
 
 
1112 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  28.65 
 
 
1092 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
1051 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.7 
 
 
1244 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
744 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.8 
 
 
621 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
692 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
595 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.79 
 
 
1215 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
673 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.2 
 
 
1255 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
509 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
499 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
595 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
595 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  26.89 
 
 
590 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  28.3 
 
 
595 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.47 
 
 
1247 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
1509 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.44 
 
 
519 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  28.32 
 
 
595 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.29 
 
 
1258 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  38.81 
 
 
234 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 
797 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  27.5 
 
 
595 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.72 
 
 
1247 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  34.72 
 
 
1247 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  27.04 
 
 
767 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1983  sensory box protein  31.73 
 
 
1136 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.37 
 
 
1098 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  27.79 
 
 
1061 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  25.67 
 
 
853 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.96 
 
 
1248 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
595 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
510 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.58 
 
 
1247 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
1062 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
1079 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  29.37 
 
 
1258 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
612 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
692 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.5 
 
 
1102 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
506 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
711 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
1262 aa  150  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
801 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
995 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.63 
 
 
1098 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  32.35 
 
 
1245 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.26 
 
 
1098 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
677 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  35.81 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1946  histidine kinase  52.59 
 
 
150 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
859 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 
509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>