150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0654 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
336 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  52.98 
 
 
334 aa  352  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  48.96 
 
 
335 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  52.31 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  50.15 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  48.47 
 
 
335 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  48.24 
 
 
335 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  46.38 
 
 
330 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  40.74 
 
 
333 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  43.2 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  43.79 
 
 
338 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  37.73 
 
 
336 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  41.95 
 
 
336 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  40.37 
 
 
336 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  40.19 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  40.19 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  40.19 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  38.96 
 
 
365 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  41.32 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  37.07 
 
 
335 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  44.28 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  38.27 
 
 
316 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  40.98 
 
 
336 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  38.23 
 
 
336 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  38.23 
 
 
336 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  40.55 
 
 
336 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  32.55 
 
 
343 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  28.47 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  31.71 
 
 
319 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  26.67 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.7 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  27.7 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.89 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.26 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0928  hypothetical protein  26.49 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0958  hypothetical protein  26.49 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.46 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.48 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.35 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  23.44 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  24.49 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.43 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  26.07 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  24.24 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0354  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.38 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.18 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.02 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.66 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.25 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  23.18 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.78 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  22.55 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  23.94 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_1885  CaCA family transporter: sodium ion/potassium ion/calcium ion  28.22 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00320098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.17 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.17 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.66 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.48 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  24.56 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.54 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.23 
 
 
311 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.3 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.17 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.14 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.52 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.71 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0194  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.54 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.163392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.76 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.26 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.64 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.28 
 
 
314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.1 
 
 
322 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.28 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.05 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  28.29 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.88 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  24.19 
 
 
318 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.46 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.18 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.66 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.9 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  24.72 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4032  sodium/calcium exchanger membrane region  23.75 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.9 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.1 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.5 
 
 
321 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.28 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.09 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.54 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  22.56 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  24.87 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0804  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.46 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.62 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  20.83 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.11 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.14 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.99 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.99 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.97 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>