215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5398 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  49.36 
 
 		 997 aa  939    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  41.74 
 
 		 1006 aa  752    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 1029 aa  2073    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  46.1 
 
 		 991 aa  845    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  46.1 
 
 		 991 aa  845    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  35.53 
 
 		 1028 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  35.92 
 
 		 1075 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  45.67 
 
 		 771 aa  532  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  37.96 
 
 		 916 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  50.82 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.04 
 
 		 988 aa  360  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  29.71 
 
 		 988 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  357  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  357  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  27.21 
 
 		 983 aa  355  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  27.88 
 
 		 987 aa  348  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  29.24 
 
 		 988 aa  343  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  32.85 
 
 		 838 aa  340  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  29.57 
 
 		 990 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  29.57 
 
 		 990 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.71 
 
 		 988 aa  337  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.32 
 
 		 988 aa  335  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.32 
 
 		 988 aa  335  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  28.87 
 
 		 989 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.12 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.12 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.12 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.12 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  29.09 
 
 		 988 aa  330  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.3 
 
 		 990 aa  330  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.54 
 
 		 988 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.23 
 
 		 990 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.23 
 
 		 990 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.23 
 
 		 990 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  27.51 
 
 		 1015 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  28.91 
 
 		 990 aa  327  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  26.13 
 
 		 992 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  324  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  324  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  324  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  29.35 
 
 		 996 aa  324  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  28.9 
 
 		 988 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  28.59 
 
 		 989 aa  322  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 		 964 aa  320  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.05 
 
 		 996 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.05 
 
 		 996 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.05 
 
 		 996 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  28.19 
 
 		 985 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.13 
 
 		 994 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.13 
 
 		 994 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  27.6 
 
 		 994 aa  296  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.19 
 
 		 862 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  29.37 
 
 		 755 aa  274  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  32.84 
 
 		 606 aa  271  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.17 
 
 		 991 aa  257  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.17 
 
 		 991 aa  257  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  26.19 
 
 		 961 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 		 976 aa  250  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 		 924 aa  249  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.63 
 
 		 988 aa  248  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.43 
 
 		 988 aa  248  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.51 
 
 		 999 aa  248  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  27.73 
 
 		 968 aa  247  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  25.9 
 
 		 991 aa  240  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 877 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  37.61 
 
 		 338 aa  237  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.1 
 
 		 992 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 992 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  31.75 
 
 		 550 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 988 aa  234  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  22.97 
 
 		 990 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  36.87 
 
 		 371 aa  229  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  25.07 
 
 		 983 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  22.89 
 
 		 1006 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  22.89 
 
 		 1006 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  44.97 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.14 
 
 		 990 aa  202  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  61.9 
 
 		 154 aa  196  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  21.6 
 
 		 1015 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  29.42 
 
 		 546 aa  192  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  21.25 
 
 		 995 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  22.96 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  22.96 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  23.49 
 
 		 986 aa  188  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.35 
 
 		 995 aa  187  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.52 
 
 		 994 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  26.84 
 
 		 1018 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.94 
 
 		 772 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  22.72 
 
 		 989 aa  184  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 929 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  28.06 
 
 		 1019 aa  180  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  22.19 
 
 		 1059 aa  178  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  30.02 
 
 		 573 aa  178  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  37.55 
 
 		 246 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  23.96 
 
 		 731 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  37.72 
 
 		 310 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  37.55 
 
 		 246 aa  175  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  26.94 
 
 		 1019 aa  175  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  35.76 
 
 		 305 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  22.43 
 
 		 1026 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>