More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4926 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4926  transcriptional regulator IclR-like protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0909011  normal  0.863129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  45.4 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  48.25 
 
 		 261 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.72 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 258 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  39.13 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  39.13 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.57 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.25 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  37.59 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  30.41 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  44.94 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  31.03 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.33 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  41.76 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  40 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  33.55 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.58 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.51 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  32.06 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.04 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.96 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.96 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  37.19 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  26.92 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  34.59 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.96 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.96 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>