153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1881 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  64.31 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  63.32 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  62.88 
 
 		 270 aa  339  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  63.6 
 
 		 259 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  62.31 
 
 		 258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  61.33 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  61.07 
 
 		 263 aa  324  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  59.22 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  54.47 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  52.53 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  54.98 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  53.33 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  51.18 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  49.21 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  47.88 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  51.18 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  44.09 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  36.58 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  33.2 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  32.45 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  32.5 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  32.5 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  31.25 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  36.18 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  34.85 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  34.44 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  37.08 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  33.74 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  33.63 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  34.3 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  31.75 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  31.6 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  35.5 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  33.75 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  34.57 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  31.52 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.42 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  31.54 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  31.54 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  35.38 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  35.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  32.86 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  31.5 
 
 		 231 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  27.73 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  33.5 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  29.45 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  32.09 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  32.66 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  25.74 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  29.59 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  28 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  31.38 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.28 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.57 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  30.48 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.17 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.75 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.75 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  30.21 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.16 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.16 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  27.41 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.75 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  27.57 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.75 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.75 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  32.52 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  28.24 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.34 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.05 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.64 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.1 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.26 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.93 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.08 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  25.38 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  27.85 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.8 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.85 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  24.51 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.89 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  34.56 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  26.12 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.82 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  27.13 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  26.67 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.34 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  26.02 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.39 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  25.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.69 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.69 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.09 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  27.87 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  29.02 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>