More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1592 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  71.86 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  74.19 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  66.28 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  66.28 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  65.58 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  43.49 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  43.72 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  44.63 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 442 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  39.3 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  41.45 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  37.76 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  36.67 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  36.36 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  35.49 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 385 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 388 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.62 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.09 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.85 
 
 		 369 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.6 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.35 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.85 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.11 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.11 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.35 
 
 		 369 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.12 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>