More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1445 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  37.3 
 
 
281 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483911  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.86 
 
 
263 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4008  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.951128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  33.86 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  25.82 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6232  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  24.4 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.72 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.72 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.72 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.35 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.64 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.73 
 
 
374 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  27.85 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.52 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.42 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.67 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.88 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.49 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.49 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.29 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  32.02 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.76 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.48 
 
 
370 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
312 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
437 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  29.7 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
346 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.15 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.11 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 
380 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.04 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.29 
 
 
371 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>