More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3040 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  65.42 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6232  alpha/beta hydrolase fold protein  39.65 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4008  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.951128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.96 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  28.68 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.24 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  23.42 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.98 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.74 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.16 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  28.07 
 
 		 355 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.45 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.82 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  25.96 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.9 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 439 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.74 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  43.33 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 441 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>