More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6232 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6232  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  43.72 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.11 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  30.05 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.69 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.2 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.71 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.88 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4008  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.951128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.82 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  21.95 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  24.28 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.64 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  31.5 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.3 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  20.89 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.51 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.01 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  24.82 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  25.25 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.74 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  20.61 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>