More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0572 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0572  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  33.19 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4008  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.951128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.46 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.8 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.8 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.74 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.1 
 
 
263 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.37 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.84 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.84 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.8 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.91 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.89 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
346 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.82 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.86 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.6 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.69 
 
 
371 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.69 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.69 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.52 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 
387 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
504 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  25.69 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  35.88 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  20.72 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.4 
 
 
372 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
289 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.95 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.19 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
339 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.03 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
331 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>