More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0769 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0769  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 553 aa  1069    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 256 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.73 
 
 		 258 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 252 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 262 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 262 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  42.59 
 
 		 257 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 268 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  43.77 
 
 		 261 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 262 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 262 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  43.73 
 
 		 259 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.08 
 
 		 268 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 254 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  44.03 
 
 		 262 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 		 269 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 258 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 259 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 259 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 259 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 265 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 265 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 265 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 		 251 aa  167  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 267 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 250 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 		 267 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 263 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 252 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 254 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  42.96 
 
 		 257 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 250 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  43.77 
 
 		 282 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 255 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 		 255 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 252 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.84 
 
 		 273 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 251 aa  159  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 253 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 262 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 254 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 255 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 256 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 251 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 254 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 250 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 		 254 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 273 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 244 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 259 aa  150  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  40.47 
 
 		 251 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  38.91 
 
 		 247 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 254 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 257 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 255 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 255 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 254 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 251 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 263 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.55 
 
 		 254 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 253 aa  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 252 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 245 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 255 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 255 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 248 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 250 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 262 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 253 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 250 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 248 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 260 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 253 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 259 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 263 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 244 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 261 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 267 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.29 
 
 		 268 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 277 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 266 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  38.49 
 
 		 264 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 249 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 250 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 250 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.36 
 
 		 257 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.92 
 
 		 254 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 257 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.66 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 248 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>