More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0222 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  62.29 
 
 		 297 aa  325  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  57.05 
 
 		 297 aa  312  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.03 
 
 		 312 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.18 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.18 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  48 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.47 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.06 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.66 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  47.33 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.8 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.02 
 
 		 307 aa  248  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  47.44 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.18 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.46 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.69 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.51 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.96 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.41 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.17 
 
 		 329 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.1 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.12 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.49 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  47 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.51 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.76 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  46.2 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  45.36 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  46.71 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  44.93 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.75 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  46 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  44.41 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  45.48 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  45.48 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  44.52 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  46.2 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.09 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  34.09 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  35.28 
 
 		 311 aa  192  8e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  35.35 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  36.95 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.63 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  36.64 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  40.33 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.07 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.78 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  35.88 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  40.74 
 
 		 342 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  34.8 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  41.72 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  32.8 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.93 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  34.11 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  39.6 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.9 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.64 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  42.37 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  37.74 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.95 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  34.11 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  34.06 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  40.34 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0801  phage integrase family protein  37.82 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  39.48 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  36.08 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  38.18 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.29 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.63 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.95 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  35.86 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.94 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  31.86 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  33.89 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  32.8 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  37.07 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  34.63 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.85 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.85 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  38.59 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.74 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.15 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  39.11 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.61 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.85 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  35.37 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  35.53 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>