More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  100 
 
 		 405 aa  809    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.93 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  30.56 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  28.87 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.37 
 
 		 723 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.16 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.66 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  29.65 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.5 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  29.09 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.37 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.04 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  28.18 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.07 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.07 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.22 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.95 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.49 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.74 
 
 		 756 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  31.06 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  25.56 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.51 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.59 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.88 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.74 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.24 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  29.71 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  30.11 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.27 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.25 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.67 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.31 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.67 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.18 
 
 		 914 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.1 
 
 		 900 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  28.42 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.65 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.63 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.52 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.55 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.97 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.84 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.41 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  28.14 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.93 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.94 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.94 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.67 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  24.22 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.48 
 
 		 654 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.38 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.92 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  26.77 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.32 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1434  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.58 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440788  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.56 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.45 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  28.25 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.58 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.1 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  28.04 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  26.87 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  23.18 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.67 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3943  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  26.98 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.705932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  19.73 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.08 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.53 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  26.35 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.47 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3510  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.18 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.221437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.64 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.17 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3200  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.88 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237038  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21160  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  27.69 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.127791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0698  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.71 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  27.64 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3292  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.7 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  23.73 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  24.26 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.32 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.32 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7655  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  27.83 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  28.39 
 
 		 587 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.32 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.57 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  28.79 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  23.38 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  22.85 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.66 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0467  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.26 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2205  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.73 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738027  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0984  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha / biotin carboxylase  25.77 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  24.62 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.19 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  28.68 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  25.77 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  27.64 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>