160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  64.02 
 
 		 269 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  54.98 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  56.08 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  47.17 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  43.28 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  42.31 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  38.97 
 
 		 342 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  34.85 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  33.45 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  35.64 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  33.45 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  37.93 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  33.82 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  32.44 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  32.57 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  31.42 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  29 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  37.44 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.37 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  29.37 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  31.05 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  34.12 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  35.87 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.57 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.57 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.57 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.59 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.59 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  33.64 
 
 		 332 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  35.45 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  29.96 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.34 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  29.88 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  29.88 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  33.81 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  32.21 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  33.02 
 
 		 322 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.27 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  29.82 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  29.12 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  31.05 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  30.73 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  27.44 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.62 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  32.84 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.1 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  30.04 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.44 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.06 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.45 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  28.52 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.03 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  32.14 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  28.4 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.82 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.28 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.69 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.64 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.94 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  31.55 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.73 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  32.27 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.28 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.79 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  27.46 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.46 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  26.15 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.41 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  28.84 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  31.48 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  25.69 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.28 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  30.17 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25.67 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  27.69 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  29.17 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  25.1 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.73 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.04 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  31.79 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  24.41 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  26.14 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  25.38 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  27.48 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  26.19 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  26.94 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  24.7 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.57 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.33 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.95 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  27.51 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  26.41 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  30.68 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  26.67 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  26.81 
 
 		 353 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.72 
 
 		 222 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>