More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  62.91 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.55 
 
 		 274 aa  348  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63 
 
 		 289 aa  341  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63 
 
 		 284 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  60.36 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.64 
 
 		 284 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.85 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.64 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  60.36 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.97 
 
 		 272 aa  334  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.97 
 
 		 279 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 		 284 aa  331  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  59.57 
 
 		 282 aa  331  8e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  59.57 
 
 		 281 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  59.34 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  59.34 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  59.34 
 
 		 284 aa  324  9e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.77 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  60.43 
 
 		 295 aa  321  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  61.29 
 
 		 296 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  61.17 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  59.93 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  56.11 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  56 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  56 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  56 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 		 269 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 		 271 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  57.88 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  58.61 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  58.24 
 
 		 273 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  59.92 
 
 		 277 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  55.04 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  55.27 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  54.71 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  51.09 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.83 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.75 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  27.82 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.6 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 256 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.05 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0228145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.81 
 
 		 247 aa  95.5  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>