More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 196 aa  287  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  63.3 
 
 		 229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  55.5 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  55.5 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  55.5 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  67.79 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  59.2 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  59.22 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  74.58 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  75.42 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  69.4 
 
 		 268 aa  188  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  57.58 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  59.88 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 168 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  66.92 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 202 aa  180  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  71.19 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  65.67 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  64.62 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  56.73 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  70.34 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  60.69 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  67.15 
 
 		 206 aa  170  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  62.12 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  62.31 
 
 		 180 aa  168  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 170 aa  167  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  48.44 
 
 		 242 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  65.33 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  60.74 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 118 aa  131  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  43.93 
 
 		 175 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 114 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 127 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  53.47 
 
 		 113 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  46.77 
 
 		 143 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 113 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 113 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 112 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 140 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50.93 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  39.86 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  46.67 
 
 		 121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  43.7 
 
 		 247 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  44.96 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 141 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 113 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  39.64 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  54.64 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  44.88 
 
 		 126 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  43.38 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  40.76 
 
 		 166 aa  104  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  51.89 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 		 133 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  45.95 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  45.03 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 138 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  48.6 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 138 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  53.61 
 
 		 113 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 113 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  42.62 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  40.72 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>