More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0360 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 365 aa  751    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  71.98 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  65.21 
 
 		 369 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  64.92 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  65.1 
 
 		 365 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  65.1 
 
 		 365 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  66.02 
 
 		 366 aa  478  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  65.19 
 
 		 372 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  64.82 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  59.56 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.31 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.57 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  51.34 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.27 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.16 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.94 
 
 		 375 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.7 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.15 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 		 375 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50.13 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 380 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.85 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 317 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  50.73 
 
 		 417 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  47.88 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  48.61 
 
 		 383 aa  348  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.37 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 327 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 375 aa  346  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.65 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 349 aa  346  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 		 359 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.14 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.34 
 
 		 376 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  48.26 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  48.26 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  48.26 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 322 aa  345  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.57 
 
 		 322 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  47.97 
 
 		 406 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.05 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.29 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  48.26 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 322 aa  342  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 321 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  49.85 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.18 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.33 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.2 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.56 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  45.38 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.9 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  55.56 
 
 		 323 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.59 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 322 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  55.94 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 369 aa  335  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 375 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  47.62 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  48.48 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  51.41 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>