106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0197 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  100 
 
 		 367 aa  756    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  21.7 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.68 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  25.33 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  18.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  22.36 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  24.22 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.51 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  32.23 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  29.5 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  20.82 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  21.09 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  22.3 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  20.2 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 873 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  21.78 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.38 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  25.85 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  31.58 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  20.06 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  27.34 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  24.43 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  22.8 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  18.24 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.77 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.32 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  22.04 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.15 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  19.02 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.91 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  23.44 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  21.97 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  30.84 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.09 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.91 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.14 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.37 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.52 
 
 		 445 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  19.78 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.23 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.37 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  23.89 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.64 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.65 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.17 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.6 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.13 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  37.5 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.8 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.22 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 429 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.21 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>