More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3790 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  95.39 
 
 		 304 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  65.12 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  64.24 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  61.95 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  62.16 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  61.84 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.64 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  56 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  55.78 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  42.15 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  41.38 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  38.13 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  48.11 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.34 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.01 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.01 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.67 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.67 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  43.52 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.01 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  36.18 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  37.12 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  37.31 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.01 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.54 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  40.71 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.83 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.64 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  42.04 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  42.49 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.01 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.75 
 
 		 339 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.99 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.87 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.51 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.25 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  46.76 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.31 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  37.61 
 
 		 435 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  43.66 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.42 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  37.85 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  42.86 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.85 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.7 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  38.29 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  31.21 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  33.07 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  39.01 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.89 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.74 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  44.28 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  39.91 
 
 		 247 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.86 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  33.2 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.65 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  30.46 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  35.51 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.88 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.28 
 
 		 236 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.59 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.91 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  29.29 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>