85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2611 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  100 
 
 		 543 aa  1110    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  89.69 
 
 		 543 aa  955    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  46.25 
 
 		 513 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  45.18 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  36.79 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  35.28 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  34.55 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  33.83 
 
 		 534 aa  251  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  32.55 
 
 		 530 aa  250  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  35.15 
 
 		 546 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  38.24 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  31.91 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  35.29 
 
 		 543 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  36.83 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 889 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  24.82 
 
 		 552 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  24.82 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  24.82 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  24.82 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  24.82 
 
 		 632 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  24.82 
 
 		 632 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  24.82 
 
 		 632 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.09 
 
 		 696 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.86 
 
 		 569 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.93 
 
 		 533 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 564 aa  87.8  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.1 
 
 		 572 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 		 583 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1150 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.32 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 1150 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  26.55 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  25.71 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.81 
 
 		 1132 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 581 aa  70.1  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  28.28 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.25 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.07 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  25.98 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1152 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  23.3 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  31.15 
 
 		 738 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.18 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.24 
 
 		 1152 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.48 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.44 
 
 		 534 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 577 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  23.51 
 
 		 562 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.55 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.42 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.02 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.75 
 
 		 546 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.61 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.82 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  22.28 
 
 		 521 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07230  cellobiose dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_2G17620)  28.76 
 
 		 780 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267409  normal  0.372324 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  23.18 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  24.44 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.54 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.84 
 
 		 544 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 		 556 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  41.94 
 
 		 629 aa  43.9  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  48.78 
 
 		 506 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>