More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2547 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  100 
 
 		 354 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  90.34 
 
 		 354 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.66 
 
 		 343 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  59.09 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  59.2 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  59.49 
 
 		 349 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  56.53 
 
 		 402 aa  345  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  55.4 
 
 		 352 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  51.44 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  48.67 
 
 		 385 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  58.8 
 
 		 247 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  44.41 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  46.05 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  43.02 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  45.59 
 
 		 371 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  41.88 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  45.43 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  45.43 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  45.43 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  42.19 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  43.5 
 
 		 347 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.94 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.53 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.53 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.53 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 		 348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  39.88 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  38.05 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.83 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40.18 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  40.96 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  51.13 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  44.37 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.64 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2400  ABC transporter related  41.27 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 353 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  48.73 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  39.63 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.71 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  39.63 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  46.33 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  48.18 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  41.16 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  40.24 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  48.64 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  40.24 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.25 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  47.75 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.7 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  45.41 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  40.67 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  41.5 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.21 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.34 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  41.11 
 
 		 353 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  41.94 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  39.63 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  42.62 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  42.94 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.23 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  38.29 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.08 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  44.95 
 
 		 342 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  39.29 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  30.68 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.11 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.34 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.65 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.96 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  40.06 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  44.12 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.86 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  40.06 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>