56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2354 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  87 
 
 		 204 aa  348  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 252 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 414 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0986  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 423 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  37.66 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 214 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 230 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>