226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3050 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3050  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
797 aa  1622    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.457092  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1393  alpha amylase catalytic region  29.97 
 
 
1016 aa  261  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4128  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 
1012 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0625116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 
611 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 
589 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  20.84 
 
 
588 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 
1753 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.46 
 
 
586 aa  107  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.65 
 
 
586 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  22.65 
 
 
586 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.65 
 
 
586 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  22.65 
 
 
586 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.65 
 
 
586 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.09 
 
 
586 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.96 
 
 
586 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.8 
 
 
586 aa  104  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.99 
 
 
586 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.12 
 
 
1847 aa  101  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.09 
 
 
582 aa  99  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  21.54 
 
 
578 aa  98.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 
1299 aa  97.8  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  22.63 
 
 
1175 aa  97.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 
1643 aa  95.5  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.05 
 
 
574 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  21.73 
 
 
586 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 
1307 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  22.66 
 
 
663 aa  91.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  22.91 
 
 
589 aa  89.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  21.64 
 
 
587 aa  89  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  21.53 
 
 
586 aa  87.8  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  22.58 
 
 
659 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  21.11 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  24.56 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  20.94 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  23.15 
 
 
600 aa  83.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  21.93 
 
 
575 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.68 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 
463 aa  80.1  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  19.7 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  21.48 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  20.54 
 
 
472 aa  79  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  20.11 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  22.48 
 
 
496 aa  77.4  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  21.55 
 
 
584 aa  75.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  19.39 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  21.42 
 
 
574 aa  73.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  21.54 
 
 
651 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  20.33 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 
583 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.71 
 
 
642 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  21.54 
 
 
493 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 
479 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  29.47 
 
 
1193 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  22.68 
 
 
622 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 
1401 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  28.51 
 
 
606 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  20.18 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  32.68 
 
 
1401 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  21.98 
 
 
608 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  21.82 
 
 
481 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  18.88 
 
 
634 aa  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  23.1 
 
 
605 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  19.27 
 
 
703 aa  65.1  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.44 
 
 
548 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 
635 aa  64.7  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  21.05 
 
 
580 aa  64.7  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  20.43 
 
 
481 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.82 
 
 
649 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  21.01 
 
 
611 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  19.72 
 
 
459 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 
493 aa  63.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.54 
 
 
515 aa  61.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  21.63 
 
 
609 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 
576 aa  61.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  21.63 
 
 
609 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 
914 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  20.38 
 
 
486 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.81 
 
 
654 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  20.87 
 
 
715 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  21.6 
 
 
610 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.45 
 
 
510 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  22.3 
 
 
762 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  20.38 
 
 
486 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.91 
 
 
610 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  22.86 
 
 
607 aa  58.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  20.28 
 
 
624 aa  57.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  23.15 
 
 
535 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  22.86 
 
 
616 aa  57  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  20.98 
 
 
488 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.85 
 
 
567 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.36 
 
 
511 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  20.05 
 
 
655 aa  57  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  22.54 
 
 
643 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  23.81 
 
 
606 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  47.69 
 
 
605 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>