More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0580 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
576 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  28 
 
 
474 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
480 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  28.88 
 
 
465 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
241 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.92 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.97 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.65 
 
 
206 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  32.7 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  27.78 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  28.71 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
218 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
210 aa  92  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
243 aa  92  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  31.12 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  31.07 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  29.33 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.91 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
248 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.86 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.02 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
199 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.62 
 
 
227 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 
280 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  27.98 
 
 
234 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  31.53 
 
 
211 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44 
 
 
449 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  31.53 
 
 
211 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.74 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.86 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.95 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.89 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.95 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 
488 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
248 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.29 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.79 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.59 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.13 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.4 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
218 aa  85.1  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.8 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.8 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.71 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  35.94 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  29.38 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  29.52 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  28.64 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  37.84 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  25.58 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  25.58 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.41 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  31.34 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.88 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.88 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  32.97 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.83 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.32 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.5 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  41.57 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>