More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1597 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  58.23 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 132 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  47.55 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.41 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  45.93 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  44.9 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  42.22 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  49.21 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  49.21 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  46.46 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.26 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.34 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.8 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  42.03 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  49.51 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  40 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  41.3 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  41.3 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  45.24 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  38.97 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  40.74 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  44.17 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>