More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7906 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  65.7 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  64.87 
 
 		 280 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  59.38 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  54.23 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  56.9 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  52.81 
 
 		 265 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  54.2 
 
 		 278 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  56.11 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  51.25 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  52.7 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  55.7 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  55.7 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  55.7 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  55.27 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  54.85 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  54.85 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  54.58 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  54.01 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  51.24 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  54.01 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  49.64 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  54.43 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  47.86 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  53.28 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  53.16 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  52.92 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  52.5 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  51.66 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  48.39 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  49.17 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  52.5 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  52.3 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.66 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  54.07 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  44.65 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  52.7 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  52.7 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  53.59 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  52.94 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  49.24 
 
 		 265 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  51.88 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  48.59 
 
 		 278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  45.82 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  49.79 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  49.79 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  52.74 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  49.37 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  46.21 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  48.95 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  48.58 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  43.48 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  43.48 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  54.43 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  46.77 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  50.63 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.74 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.1 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  53.59 
 
 		 259 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.74 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  46.67 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  48.59 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  49.37 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  51.65 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.39 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  51.43 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.01 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.01 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  47.96 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  47.96 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  47.96 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  48.96 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  44.8 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.51 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.83 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  42.55 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  46.72 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.21 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  48.31 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  47.68 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.08 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  42.03 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  41.28 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  41.28 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  45.78 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.53 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.88 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  44.73 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1131  NLPA lipoprotein  48.76 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  47.06 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>