More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2335 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  80.65 
 
 		 274 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  80.24 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  80.24 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  72.51 
 
 		 269 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  72.58 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  53.72 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  53.44 
 
 		 280 aa  238  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.03 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  48.33 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.12 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  47.56 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  49.2 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  49.2 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  49.2 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  49.2 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  45.82 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  47.15 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  44.23 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  43.08 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  43.46 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.66 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  46.06 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.44 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  43.8 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  44.19 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  44.19 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  43.8 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  44.19 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  45.64 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.77 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.41 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  46.62 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.35 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.25 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.48 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  45.53 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  43.93 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  44.81 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  45.45 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  41.73 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  42.48 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  43.02 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  46 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  45.08 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  43.57 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  45.08 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  43.89 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  41.11 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  45.08 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  45.64 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  45.64 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.72 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.38 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  41.63 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  43.08 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  40.59 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.87 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  45.95 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  42.48 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  42.75 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  44.67 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  42.21 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  43.82 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  40.86 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.3 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  42.91 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  47.6 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  43.08 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  42.62 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  41.41 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.17 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  42.75 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  39.83 
 
 		 529 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  40.89 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  47.2 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  45.16 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  42.68 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  42.31 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.31 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  43.46 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  41.13 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  39.83 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  41.49 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  37.92 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  39.52 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>